Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63121 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms