Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPD1P62314 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPD1P62314 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPD1P62314 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPD1P62314 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms