Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP46P62068 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP46P62068 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP46P62068 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP46P62068 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP46P62068 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP46P62068 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP46P62068 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP46P62068 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP46P62068 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP46P62068 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP46P62068 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP46P62068 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP46P62068 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP46P62068 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP46P62068 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP46P62068 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP46P62068 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP46P62068 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP46P62068 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP46P62068 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP46P62068 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP46P62068 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP46P62068 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP46P62068 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
USP46P62068 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP46P62068 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP46P62068 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP46P62068 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP46P62068 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP46P62068 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP46P62068 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP46P62068 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP46P62068 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP46P62068 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP46P62068 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP46P62068 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP46P62068 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP46P62068 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP46P62068 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP46P62068 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP46P62068 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP46P62068 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP46P62068 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP46P62068 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP46P62068 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP46P62068 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP46P62068 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP46P62068 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP46P62068 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP46P62068 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP46P62068 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP46P62068 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP46P62068 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP46P62068 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP46P62068 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP46P62068 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP46P62068 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP46P62068 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP46P62068 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP46P62068 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP46P62068 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP46P62068 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP46P62068 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP46P62068 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP46P62068 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP46P62068 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP46P62068 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP46P62068 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP46P62068 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP46P62068 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP46P62068 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP46P62068 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP46P62068 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP46P62068 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP46P62068 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP46P62068 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP46P62068 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP46P62068 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP46P62068 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP46P62068 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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