Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V0D1P61421 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V0D1P61421 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms