Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTBP60709 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTBP60709 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTBP60709 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTBP60709 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTBP60709 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTBP60709 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACTBP60709 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTBP60709 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTBP60709 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTBP60709 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTBP60709 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTBP60709 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTBP60709 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTBP60709 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTBP60709 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTBP60709 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTBP60709 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTBP60709 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTBP60709 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTBP60709 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTBP60709 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTBP60709 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTBP60709 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTBP60709 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACTBP60709 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTBP60709 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTBP60709 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTBP60709 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTBP60709 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACTBP60709 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTBP60709 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTBP60709 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTBP60709 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTBP60709 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTBP60709 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTBP60709 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTBP60709 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTBP60709 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ACTBP60709 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ACTBP60709 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTBP60709 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms