Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTPNP58546 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTPNP58546 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTPNP58546 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTPNP58546 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTPNP58546 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTPNP58546 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTPNP58546 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTPNP58546 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTPNP58546 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTPNP58546 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTPNP58546 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTPNP58546 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTPNP58546 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTPNP58546 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTPNP58546 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTPNP58546 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTPNP58546 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTPNP58546 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTPNP58546 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTPNP58546 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTPNP58546 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTPNP58546 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTPNP58546 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTPNP58546 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTPNP58546 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTPNP58546 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTPNP58546 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTPNP58546 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTPNP58546 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTPNP58546 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTPNP58546 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTPNP58546 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTPNP58546 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTPNP58546 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTPNP58546 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTPNP58546 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTPNP58546 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTPNP58546 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTPNP58546 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTPNP58546 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTPNP58546 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTPNP58546 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTPNP58546 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTPNP58546 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTPNP58546 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTPNP58546 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTPNP58546 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTPNP58546 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTPNP58546 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTPNP58546 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTPNP58546 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTPNP58546 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTPNP58546 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTPNP58546 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTPNP58546 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTPNP58546 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTPNP58546 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms