Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMPRSS3P57727 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS3P57727 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms