Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC8A3P57103 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A3P57103 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms