Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BACE1P56817 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BACE1P56817 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BACE1P56817 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BACE1P56817 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BACE1P56817 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BACE1P56817 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BACE1P56817 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BACE1P56817 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BACE1P56817 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BACE1P56817 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BACE1P56817 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BACE1P56817 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BACE1P56817 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BACE1P56817 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BACE1P56817 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BACE1P56817 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BACE1P56817 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BACE1P56817 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BACE1P56817 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BACE1P56817 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BACE1P56817 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BACE1P56817 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BACE1P56817 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BACE1P56817 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BACE1P56817 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BACE1P56817 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BACE1P56817 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BACE1P56817 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BACE1P56817 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BACE1P56817 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BACE1P56817 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BACE1P56817 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BACE1P56817 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BACE1P56817 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BACE1P56817 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BACE1P56817 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BACE1P56817 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BACE1P56817 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BACE1P56817 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BACE1P56817 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BACE1P56817 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BACE1P56817 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BACE1P56817 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BACE1P56817 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BACE1P56817 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BACE1P56817 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BACE1P56817 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BACE1P56817 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BACE1P56817 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BACE1P56817 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BACE1P56817 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BACE1P56817 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BACE1P56817 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BACE1P56817 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BACE1P56817 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BACE1P56817 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BACE1P56817 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BACE1P56817 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms