Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3BP55884 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3BP55884 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms