Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX9P55771 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX9P55771 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX9P55771 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX9P55771 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX9P55771 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX9P55771 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX9P55771 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX9P55771 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX9P55771 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX9P55771 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX9P55771 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAX9P55771 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAX9P55771 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX9P55771 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX9P55771 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX9P55771 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAX9P55771 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX9P55771 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX9P55771 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX9P55771 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX9P55771 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX9P55771 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PAX9P55771 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PAX9P55771 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PAX9P55771 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX9P55771 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX9P55771 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX9P55771 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX9P55771 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX9P55771 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX9P55771 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX9P55771 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PAX9P55771 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PAX9P55771 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX9P55771 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms