Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH15P55291 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH15P55291 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH15P55291 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH15P55291 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH15P55291 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH15P55291 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH15P55291 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH15P55291 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH15P55291 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH15P55291 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH15P55291 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH15P55291 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH15P55291 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH15P55291 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH15P55291 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH15P55291 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH15P55291 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH15P55291 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH15P55291 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms