Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDKN2DP55273 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2DP55273 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms