Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCKAP1LP55160 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCKAP1LP55160 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCKAP1LP55160 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms