Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MFAP3P55082 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.5 ms