Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1B3P54709 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms