Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRISP3P54108 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRISP3P54108 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRISP3P54108 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms