Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOP1P52888 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOP1P52888 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOP1P52888 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOP1P52888 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOP1P52888 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THOP1P52888 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THOP1P52888 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THOP1P52888 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
THOP1P52888 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THOP1P52888 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOP1P52888 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOP1P52888 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOP1P52888 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOP1P52888 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOP1P52888 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOP1P52888 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOP1P52888 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOP1P52888 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
THOP1P52888 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOP1P52888 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOP1P52888 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOP1P52888 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THOP1P52888 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THOP1P52888 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THOP1P52888 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THOP1P52888 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THOP1P52888 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
THOP1P52888 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THOP1P52888 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
THOP1P52888 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THOP1P52888 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THOP1P52888 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THOP1P52888 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THOP1P52888 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THOP1P52888 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
THOP1P52888 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THOP1P52888 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THOP1P52888 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THOP1P52888 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THOP1P52888 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THOP1P52888 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THOP1P52888 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THOP1P52888 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THOP1P52888 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THOP1P52888 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THOP1P52888 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THOP1P52888 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THOP1P52888 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THOP1P52888 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THOP1P52888 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THOP1P52888 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOP1P52888 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOP1P52888 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOP1P52888 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOP1P52888 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOP1P52888 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOP1P52888 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOP1P52888 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOP1P52888 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOP1P52888 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THOP1P52888 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOP1P52888 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOP1P52888 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOP1P52888 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOP1P52888 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOP1P52888 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOP1P52888 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOP1P52888 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOP1P52888 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOP1P52888 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOP1P52888 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOP1P52888 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOP1P52888 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOP1P52888 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
THOP1P52888 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOP1P52888 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOP1P52888 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOP1P52888 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOP1P52888 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOP1P52888 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOP1P52888 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOP1P52888 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOP1P52888 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOP1P52888 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOP1P52888 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THOP1P52888 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THOP1P52888 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms