Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA3P52797 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA3P52797 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms