Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 CDK13-206ENST00000611390 2222 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.316e-9■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 CDK13-205ENST00000484589 2111 ntTSL 1 (best)13.05□□□□□ -0.326e-9■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.815e-8■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 DTYMK-202ENST00000400770 1089 ntTSL 1 (best)25.97■■□□□ 1.755e-8■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 DTYMK-205ENST00000445261 518 ntTSL 522.81■■□□□ 1.245e-8■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 DTYMK-203ENST00000420144 575 ntTSL 517.24■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 DTYMK-204ENST00000432348 926 ntTSL 510.57□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 230.03■■■□□ 2.42e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-210ENST00000576925 611 ntTSL 227.76■■■□□ 2.032e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 427.76■■■□□ 2.032e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.762e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.752e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.752e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 324.28■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 224■■□□□ 1.432e-7■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.658e-9■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.118e-9■■■■■ 33.2
HNRNPMP52272 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.165e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 CLK3-210ENST00000563112 665 ntTSL 326.72■■□□□ 1.876e-20■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.347e-7■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.477e-7■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.667e-7■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 HNRNPM-207ENST00000597081 1004 ntTSL 533.3■■■□□ 2.929e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 SEC22A-208ENST00000487572 870 ntTSL 330.36■■■□□ 2.451e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 SEC22A-203ENST00000466950 565 ntTSL 520■□□□□ 0.791e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 SEC22A-205ENST00000477063 759 ntTSL 519.49■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 SEC22A-204ENST00000473494 1011 ntTSL 37.23□□□□□ -1.251e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.481e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 CEP44-208ENST00000508483 864 ntTSL 44.44□□□□□ -1.71e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.91e-9■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 ZNF444-203ENST00000587195 571 ntTSL 435.65■■■■□ 3.31e-6■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.991e-6■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 ZNF444-206ENST00000587664 568 ntTSL 330.66■■■□□ 2.51e-6■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.491e-6■■■■■ 33.1
HNRNPMP52272 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.882e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.662e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-209ENST00000562986 468 ntTSL 425.07■■□□□ 1.62e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-223ENST00000568760 579 ntTSL 425.06■■□□□ 1.62e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-208ENST00000562578 573 ntTSL 424.87■■□□□ 1.572e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-213ENST00000563848 649 ntTSL 324.09■■□□□ 1.452e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.22e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-205ENST00000561959 558 ntTSL 521.96■■□□□ 1.112e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -02e-11■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SPON2-204ENST00000502483 571 ntTSL 439.1■■■■□ 3.851e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SPON2-220ENST00000515004 571 ntTSL 435.28■■■■□ 3.241e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.761e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.721e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.511e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.41e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SNAP47-208ENST00000478768 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.51■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.48■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 33
HNRNPMP52272 XRCC5-207ENST00000471649 610 ntTSL 28.38□□□□□ -1.073e-8■■■■■ 33
HNRNPMP52272 HDLBP-215ENST00000427487 924 ntTSL 518.24■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 HDLBP-241ENST00000487169 4339 ntTSL 217.34■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 516.38■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 HDLBP-225ENST00000452931 801 ntTSL 514.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 NDUFA10-210ENST00000471378 582 ntTSL 315.35■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 33
HNRNPMP52272 TBC1D15-216ENST00000549402 593 ntTSL 527.55■■■□□ 26e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 TBC1D15-211ENST00000491063 1223 ntTSL 1 (best)27.55■■■□□ 26e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 TBC1D15-208ENST00000482439 863 ntTSL 521.18■□□□□ 0.986e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 TBC1D15-214ENST00000546932 557 ntTSL 421■□□□□ 0.956e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 TBC1D15-206ENST00000474468 582 ntTSL 421■□□□□ 0.956e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 TBC1D15-212ENST00000498482 566 ntTSL 417.83■□□□□ 0.446e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 TBC1D15-205ENST00000472611 640 ntTSL 317.83■□□□□ 0.446e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 TBC1D15-204ENST00000468049 363 ntTSL 55.65□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)32.37■■■□□ 2.772e-6■■■■■ 33
HNRNPMP52272 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 230.4■■■□□ 2.462e-6■■■■■ 33
HNRNPMP52272 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 425.58■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 33
HNRNPMP52272 DYRK1A-208ENST00000498351 224 ntTSL 1 (best)2.85□□□□□ -1.952e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.059e-10■■■■■ 33
HNRNPMP52272 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.279e-10■■■■■ 33
HNRNPMP52272 WDR35-203ENST00000414212 3483 ntTSL 55.83□□□□□ -1.489e-10■■■■■ 33
HNRNPMP52272 ZNF483-203ENST00000358151 2433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 33
HNRNPMP52272 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.54□□□□□ -1.21e-12■■■■■ 32.9
HNRNPMP52272 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.421e-8■■■■■ 32.9
HNRNPMP52272 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 32.9
HNRNPMP52272 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 KRIT1-202ENST00000394503 2827 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 32.8
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 423.1 ms