Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDR1P51861 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDR1P51861 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDR1P51861 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDR1P51861 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDR1P51861 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDR1P51861 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDR1P51861 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDR1P51861 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDR1P51861 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDR1P51861 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDR1P51861 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR1P51861 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR1P51861 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR1P51861 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR1P51861 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDR1P51861 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR1P51861 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR1P51861 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR1P51861 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR1P51861 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR1P51861 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR1P51861 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDR1P51861 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDR1P51861 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR1P51861 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR1P51861 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR1P51861 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR1P51861 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR1P51861 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR1P51861 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR1P51861 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDR1P51861 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR1P51861 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR1P51861 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR1P51861 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR1P51861 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR1P51861 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDR1P51861 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDR1P51861 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR1P51861 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR1P51861 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR1P51861 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDR1P51861 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR1P51861 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR1P51861 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR1P51861 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR1P51861 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR1P51861 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDR1P51861 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDR1P51861 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms