Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR4P51679 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR4P51679 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR4P51679 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR4P51679 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR4P51679 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR4P51679 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR4P51679 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR4P51679 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR4P51679 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR4P51679 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR4P51679 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR4P51679 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR4P51679 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR4P51679 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR4P51679 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCR4P51679 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCR4P51679 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCR4P51679 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCR4P51679 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCR4P51679 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCR4P51679 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCR4P51679 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCR4P51679 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCR4P51679 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCR4P51679 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCR4P51679 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCR4P51679 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCR4P51679 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCR4P51679 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCR4P51679 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCR4P51679 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCR4P51679 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCR4P51679 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCR4P51679 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCR4P51679 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms