Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D1P51668 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D1P51668 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms