Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DAP3P51398 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DAP3P51398 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DAP3P51398 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DAP3P51398 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
DAP3P51398 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DAP3P51398 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DAP3P51398 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DAP3P51398 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DAP3P51398 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DAP3P51398 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DAP3P51398 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DAP3P51398 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DAP3P51398 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DAP3P51398 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DAP3P51398 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DAP3P51398 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DAP3P51398 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DAP3P51398 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DAP3P51398 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DAP3P51398 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DAP3P51398 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DAP3P51398 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DAP3P51398 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DAP3P51398 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
DAP3P51398 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DAP3P51398 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DAP3P51398 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DAP3P51398 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DAP3P51398 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DAP3P51398 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DAP3P51398 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DAP3P51398 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DAP3P51398 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DAP3P51398 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DAP3P51398 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DAP3P51398 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DAP3P51398 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DAP3P51398 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DAP3P51398 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DAP3P51398 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DAP3P51398 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DAP3P51398 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DAP3P51398 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DAP3P51398 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DAP3P51398 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DAP3P51398 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DAP3P51398 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DAP3P51398 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DAP3P51398 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DAP3P51398 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DAP3P51398 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DAP3P51398 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DAP3P51398 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms