Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUMBP49757 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUMBP49757 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUMBP49757 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUMBP49757 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUMBP49757 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUMBP49757 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUMBP49757 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUMBP49757 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUMBP49757 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUMBP49757 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUMBP49757 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUMBP49757 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUMBP49757 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUMBP49757 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUMBP49757 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUMBP49757 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUMBP49757 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUMBP49757 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUMBP49757 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUMBP49757 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUMBP49757 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUMBP49757 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUMBP49757 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUMBP49757 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUMBP49757 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUMBP49757 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUMBP49757 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUMBP49757 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUMBP49757 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUMBP49757 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUMBP49757 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUMBP49757 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUMBP49757 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUMBP49757 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUMBP49757 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUMBP49757 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUMBP49757 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUMBP49757 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUMBP49757 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUMBP49757 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUMBP49757 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUMBP49757 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUMBP49757 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUMBP49757 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUMBP49757 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUMBP49757 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUMBP49757 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUMBP49757 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUMBP49757 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUMBP49757 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUMBP49757 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUMBP49757 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUMBP49757 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUMBP49757 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUMBP49757 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUMBP49757 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUMBP49757 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUMBP49757 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUMBP49757 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms