Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP4P49662 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP4P49662 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP4P49662 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP4P49662 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP4P49662 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP4P49662 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP4P49662 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP4P49662 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP4P49662 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP4P49662 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP4P49662 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP4P49662 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP4P49662 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP4P49662 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP4P49662 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP4P49662 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP4P49662 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP4P49662 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP4P49662 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP4P49662 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP4P49662 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP4P49662 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP4P49662 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP4P49662 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP4P49662 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP4P49662 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP4P49662 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP4P49662 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP4P49662 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP4P49662 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP4P49662 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP4P49662 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP4P49662 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP4P49662 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP4P49662 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP4P49662 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP4P49662 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP4P49662 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP4P49662 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP4P49662 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP4P49662 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP4P49662 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP4P49662 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP4P49662 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP4P49662 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CASP4P49662 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP4P49662 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP4P49662 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP4P49662 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP4P49662 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP4P49662 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP4P49662 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms