Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNTAP49354 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTAP49354 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTAP49354 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNTAP49354 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNTAP49354 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNTAP49354 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTAP49354 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTAP49354 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTAP49354 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTAP49354 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTAP49354 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTAP49354 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTAP49354 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNTAP49354 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTAP49354 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTAP49354 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTAP49354 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNTAP49354 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTAP49354 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTAP49354 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTAP49354 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTAP49354 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTAP49354 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNTAP49354 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTAP49354 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNTAP49354 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTAP49354 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTAP49354 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTAP49354 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTAP49354 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTAP49354 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTAP49354 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTAP49354 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTAP49354 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTAP49354 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTAP49354 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTAP49354 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTAP49354 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTAP49354 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTAP49354 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTAP49354 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTAP49354 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTAP49354 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTAP49354 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTAP49354 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms