Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPINT3P49223 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPINT3P49223 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms