Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNNI2P48788 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNI2P48788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms