Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A6P48664 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC1A6P48664 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms