Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRA4P48169 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRA4P48169 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms