Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADSBP45954 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms