Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK3P41970 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK3P41970 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK3P41970 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK3P41970 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK3P41970 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ELK3P41970 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELK3P41970 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELK3P41970 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELK3P41970 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELK3P41970 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELK3P41970 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELK3P41970 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELK3P41970 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK3P41970 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK3P41970 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK3P41970 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK3P41970 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK3P41970 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK3P41970 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELK3P41970 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELK3P41970 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELK3P41970 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELK3P41970 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELK3P41970 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELK3P41970 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELK3P41970 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ELK3P41970 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ELK3P41970 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ELK3P41970 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ELK3P41970 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ELK3P41970 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK3P41970 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK3P41970 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK3P41970 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK3P41970 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK3P41970 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELK3P41970 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ELK3P41970 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ELK3P41970 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ELK3P41970 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ELK3P41970 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ELK3P41970 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ELK3P41970 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ELK3P41970 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ELK3P41970 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ELK3P41970 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ELK3P41970 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ELK3P41970 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK3P41970 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK3P41970 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK3P41970 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK3P41970 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK3P41970 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK3P41970 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK3P41970 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ELK3P41970 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ELK3P41970 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELK3P41970 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK3P41970 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK3P41970 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK3P41970 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK3P41970 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK3P41970 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK3P41970 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELK3P41970 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELK3P41970 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELK3P41970 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELK3P41970 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELK3P41970 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELK3P41970 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELK3P41970 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELK3P41970 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELK3P41970 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms