Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHAP40939 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HADHAP40939 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHAP40939 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHAP40939 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHAP40939 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHAP40939 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHAP40939 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHAP40939 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHAP40939 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HADHAP40939 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HADHAP40939 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HADHAP40939 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHAP40939 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHAP40939 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHAP40939 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HADHAP40939 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HADHAP40939 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HADHAP40939 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHAP40939 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHAP40939 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHAP40939 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHAP40939 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHAP40939 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHAP40939 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HADHAP40939 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HADHAP40939 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HADHAP40939 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HADHAP40939 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HADHAP40939 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HADHAP40939 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HADHAP40939 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HADHAP40939 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HADHAP40939 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHAP40939 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHAP40939 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms