Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 ARG8YOL140W 1272 nt6.83□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 PAT1YCR077C 2391 nt6.82□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 RSC4YKR008W 1878 nt6.82□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 OAZ1YPL052W 879 nt6.82□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 AIM10YER087W 1731 nt6.82□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 LYS2YBR115C 4179 nt6.81□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 QDR3YBR043C 2070 nt6.81□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 VPS29YHR012W 849 nt6.81□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 ECM10YEL030W 1935 nt6.8□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 SCM3YDL139C 672 nt6.79□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 BIM1YER016W 1035 nt6.79□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 Q0182Q0182 405 nt6.79□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 SAC6YDR129C 1929 nt6.79□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 MNN10YDR245W 1182 nt6.78□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 PEP4YPL154C 1218 nt6.78□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 GPT2YKR067W 2232 nt6.77□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 TIF5YPR041W 1218 nt6.77□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 CEF1YMR213W 1773 nt6.76□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 ATM1YMR301C 2073 nt6.76□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 MRM2YGL136C 963 nt6.76□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 YLR317WYLR317W 435 nt6.76□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 ERG4YGL012W 1422 nt6.76□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 YOL131WYOL131W 327 nt6.75□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 ACF2YLR144C 2340 nt6.75□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 ACO1YLR304C 2337 nt6.75□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 ATP1YBL099W 1638 nt6.74□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 HRP1YOL123W 1605 nt6.74□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 CCS1YMR038C 750 nt6.74□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 VMA2YBR127C 1554 nt6.74□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 SSK1YLR006C 2139 nt6.73□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 GUA1YMR217W 1578 nt6.73□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 MCH4YOL119C 1506 nt6.73□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 ENT5YDR153C 1236 nt6.72□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 ASH1YKL185W 1767 nt6.71□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 DCC1YCL016C 1143 nt6.71□□□□□ -1.33
YRF1-2P40105 THI4YGR144W 981 nt6.71□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 CKB2YOR039W 777 nt6.71□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 YIL067CYIL067C 2037 nt6.7□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 VPS5YOR069W 2028 nt6.7□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 ENT2YLR206W 1842 nt6.7□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 YDR541CYDR541C 1035 nt6.7□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 EXO70YJL085W 1872 nt6.69□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 YKE4YIL023C 1041 nt6.69□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 JEM1YJL073W 1938 nt6.68□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 SEH1YGL100W 1050 nt6.68□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 ULA1YPL003W 1389 nt6.67□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 SLC1YDL052C 912 nt6.67□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 IDP1YDL066W 1287 nt6.67□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 TRP5YGL026C 2124 nt6.67□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 YNG2YHR090C 849 nt6.67□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 KEX2YNL238W 2445 nt6.66□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 MND2YIR025W 1107 nt6.66□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 FAU1YER183C 636 nt6.65□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 RAP1YNL216W 2484 nt6.65□□□□□ -1.34
YRF1-2P40105 RHO4YKR055W 876 nt6.65□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 PSH1YOL054W 1221 nt6.65□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 SAF1YBR280C 1914 nt6.64□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 SRV2YNL138W 1581 nt6.64□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 VMA13YPR036W 1437 nt6.64□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 PDH1YPR002W 1551 nt6.64□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 RIO1YOR119C 1455 nt6.63□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 NOT3YIL038C 2511 nt6.63□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 BNA6YFR047C 888 nt6.63□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 MAP2YBL091C 1266 nt6.63□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 UTP18YJL069C 1785 nt6.63□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 MTC5YDR128W 3447 nt6.63□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 DBR1YKL149C 1218 nt6.62□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 NOG2YNR053C 1461 nt6.62□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 MRF1YGL143C 1242 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 PRP2YNR011C 2631 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 QRI1YDL103C 1434 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 CLB1YGR108W 1416 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 SMF3YLR034C 1422 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 APJ1YNL077W 1587 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 YDL027CYDL027C 1263 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 CUE5YOR042W 1236 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 RPL21BYPL079W 483 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 RRT2YBR246W 1164 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 RPT4YOR259C 1314 nt6.61□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 RGD1YBR260C 2001 nt6.6□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 YDR133CYDR133C 336 nt6.6□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 ADE4YMR300C 1533 nt6.6□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 YNL057WYNL057W 333 nt6.6□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 GPM3YOL056W 912 nt6.6□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 SNU66YOR308C 1764 nt6.6□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 GEX1YCL073C 1848 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 GEX2YKR106W 1848 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 YMR027WYMR027W 1413 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 SEC12YNR026C 1416 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 YLF2YHL014C 1218 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 APN1YKL114C 1104 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 UBA3YPR066W 900 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 YFL042CYFL042C 2025 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 YEH2YLR020C 1617 nt6.59□□□□□ -1.35
YRF1-2P40105 AVT3YKL146W 2079 nt6.59□□□□□ -1.36
YRF1-2P40105 PIF1YML061C 2580 nt6.58□□□□□ -1.36
YRF1-2P40105 SCS2YER120W 735 nt6.58□□□□□ -1.36
YRF1-2P40105 YNK1YKL067W 462 nt6.58□□□□□ -1.36
YRF1-2P40105 PGA2YNL149C 390 nt6.58□□□□□ -1.36
YRF1-2P40105 POP3YNL282W 588 nt6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81.4 ms