Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3P39023 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3P39023 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3P39023 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL3P39023 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL3P39023 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL3P39023 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL3P39023 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPL3P39023 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL3P39023 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL3P39023 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3P39023 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3P39023 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3P39023 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3P39023 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL3P39023 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL3P39023 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3P39023 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3P39023 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3P39023 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3P39023 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3P39023 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3P39023 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3P39023 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL3P39023 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3P39023 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3P39023 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL3P39023 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3P39023 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3P39023 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3P39023 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL3P39023 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL3P39023 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3P39023 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3P39023 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3P39023 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL3P39023 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL3P39023 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3P39023 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3P39023 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3P39023 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3P39023 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3P39023 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3P39023 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3P39023 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL3P39023 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL3P39023 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms