Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IGHMBP2P38935 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IGHMBP2P38935 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGHMBP2P38935 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms