Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA7P36544 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms