Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CYLC1P35663 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms