Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDIT3P35638 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDIT3P35638 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDIT3P35638 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms