Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD13P35453 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HOXD13P35453 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms