Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCGF2P35227 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF2P35227 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms