Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKBRP32239 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms