Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXD11P31277 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXD11P31277 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms