Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA13P31271 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXA13P31271 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA13P31271 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms