Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPIFP30405 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPIFP30405 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPIFP30405 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPIFP30405 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPIFP30405 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPIFP30405 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPIFP30405 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPIFP30405 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPIFP30405 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PPIFP30405 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PPIFP30405 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPIFP30405 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPIFP30405 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPIFP30405 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPIFP30405 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPIFP30405 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPIFP30405 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPIFP30405 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPIFP30405 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPIFP30405 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPIFP30405 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPIFP30405 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPIFP30405 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPIFP30405 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPIFP30405 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPIFP30405 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPIFP30405 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPIFP30405 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPIFP30405 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPIFP30405 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPIFP30405 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPIFP30405 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPIFP30405 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPIFP30405 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPIFP30405 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPIFP30405 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPIFP30405 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPIFP30405 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPIFP30405 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms