Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFS1P28331 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS1P28331 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms