Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARNTP27540 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARNTP27540 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARNTP27540 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARNTP27540 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTP27540 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARNTP27540 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARNTP27540 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARNTP27540 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARNTP27540 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARNTP27540 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTP27540 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTP27540 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTP27540 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTP27540 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTP27540 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTP27540 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTP27540 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTP27540 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTP27540 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTP27540 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTP27540 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTP27540 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTP27540 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTP27540 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTP27540 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTP27540 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTP27540 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTP27540 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTP27540 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTP27540 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTP27540 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTP27540 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTP27540 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTP27540 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTP27540 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTP27540 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTP27540 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARNTP27540 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARNTP27540 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARNTP27540 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARNTP27540 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARNTP27540 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARNTP27540 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTP27540 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTP27540 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTP27540 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTP27540 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTP27540 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTP27540 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTP27540 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTP27540 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTP27540 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTP27540 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTP27540 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTP27540 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTP27540 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTP27540 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTP27540 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARNTP27540 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms