Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRYBB3P26998 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms