Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HMGB2P26583 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HMGB2P26583 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HMGB2P26583 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms